鑒於船舶檢驗與航行安全息息相關，世界各航運大國均設立本國驗船機構以嚴格執行船舶檢驗，我航運業、保險業及造船業各界有識之士，為求航業蓬勃發展，於民國 40 年 2 月 15 日成立驗船協會，為社團法人機構，對入級船舶施行檢驗，並受內政部與交通部共同監督。
民國 65 年依「驗船機構監督辦法」第十六條規定：「本國驗船機構應為財團法人並受交通部直接監督。」據此，航業界及保險業計 31 個單位認捐基金，並於民國 67 年 3 月 20 日舉行第一次捐助人會議，通過捐助章程、推選董事及監察人，自此宣告成立驗船中心，英文簡稱 CR。後經交通部許可設立，並於民國 67 年 7 月 1 日起正式由驗船中心接辦原驗船協會辦理之船舶檢驗工作。
民國 103 年 5 月 2 日，為提供更完整、更國際化之服務，將英文名稱定為 CR Classification Society。驗船中心為適用財團法人法之民間捐助財團法人，不以營利為目的之純技術性服務事業機構，目標為提供優良技術、高度效率與熱忱之服務，工作據點遍及世界各重要港口，為船東、造船廠及機材製造廠商提供最便捷之服務。
本中心品質政策係提昇服務品質，以增進船舶及海上人命安全，並防止船舶對海洋造成污染。為達成使命，本中心依據 ISO 9001之標準建立品質管理系統，並於民國 84 年 11 月 10 日由經濟部商品檢驗局認證通過。此外，本中心亦獲交通部認可，符合 IMO 決議案MSC.349(92)「認可機構章程(RO Code)」之要求。為了滿足顧客的需求及各界的期望，本中心持續因應外在環境改變而持續加強管理，以維持品質管理系統的有效性。